孕育之山
富士山山顶年平均气温约为-6℃，夏季平均气温也不会超过10℃。海拔越高，气温就越低，植物也会随海拔高度的变化而有所不同。这被称作垂直分布。在海拔900米以上的山地可以看到阔叶林，1600米以上的亚高山地带以针叶树为主,到了2500米以上的高山地带，只有高山蓼植物等高山植物。3300米以上则只能看到苔藓类植物了。
经确认，包括日本睡鼠和梅花鹿等在内，这里有40种哺乳动物，其种类....
涌玉池
富士山的地下水从位于富士山本宫浅间大社境内的涌玉池中涌出，出水量约为每天20万吨，温度14℃，全年无较大变动。在荡漾着清澈泉水的涌玉池里，水草（梅花藻）繁茂，野鸭戏水。涌玉池过去是修行者的沐浴净身的地方，如今已成为休憩的场所。
骏河湾海底涌泉
请用摄像头扫描展厅内的二维码，观看视频。
富士山为其山麓地区带来了丰富的地下水，但也有一部分作为涌泉从骏河湾海底涌出(海底涌泉)。最新调查结果显示，在田子浦近海西侧水深120至140米的海域附近确认到了海底涌泉，从其化学组成和电导率来看，其中包含了不少富士山的淡水地下水。
栖息在富士山的鸟类鸣叫声
您可以听到"富士山的自然环境"展示的6种鸟和静冈县鸟紫寿带的叫声。【提供：NPO法人Bird Research】
雨燕
柳莺
红腹灰雀
白腹蓝鹟
黄眉姬鹟
澳南沙锥
紫寿带鸟
此处墙面与地面的左官（泥瓦工程）是由左官技能士挟土秀平施作而成，表现出富士山的地层、背景的天空及骏河湾的海底地形。装修时并未使用颜料，完全以天然土的色调呈现出浓淡层次，富士山背景的天空则使用了红土。
富士山的一大特征即为其丰沛水源。从海中蒸发的水于山顶变为雪及雨，并渗入山体的地表下，经过数年后，再自山腹、山麓甚至是海底涌出。此一水循环滋养着从高山带至骏河湾海底的许多生命。在此，将介绍浅间大社的涌玉池及近年发现的海底涌泉影像，请您在此感受富士山那生机勃勃的水循环。
使用亚克力标本、3D打印模型、岩石标本等，按不同的海拔高度，介绍从富士山山顶到骏河湾海底的各种动物、植物、昆虫及鱼类。这些模型和标本嵌在壁上，展示了富士山的自然环境。墙壁上的动物外形为实体大小。
从水深2,500米的骏河湾海底，到海拔3,776米的富士山顶，在富士山附近，即使在恶劣的自然环境中，也栖息着多种多样的生物。
这里按不同的海拔高度介绍其中的一个例子。