孕育之山
富士山頂年平均溫度約為零下6℃，即使是夏天，平均溫度也不超過10℃。隨著海拔的升高，氣溫下降，生長的植物也發生了變化。此現象稱為垂直分佈，海拔900公尺以上富士山區可見闊葉林，1,600公尺以上亞高山地帶以針葉樹為主，海拔2,500公尺以上高山地區只有御蓼等的高山植物，而3,300公尺以上只能看到苔蘚類植物。
哺乳動物方面，已確認了日本睡鼠和梅花鹿等40種，約佔日本陸地哺乳動物的....
湧玉池
富士山本宮淺間大社境內的湧玉池水是富士山直接湧出的地下水。據說一天的湧出量約20萬噸，全年水溫維持在14℃左右。湧玉池水清澈見底，水草（梅花藻）茂盛，鴨子在水中遊動。湧玉池過去是修行者沐浴淨身的地方，現今已成為休憩場所。
駿河灣海底泉
使用相機讀取展示室的二維碼即可觀看影片。
富士山為山麓地區帶來豐富的地下水，但其中一部分是來自駿河灣的海底（海底泉）。根據最新調查得知，在田子之浦海域西側120～140m深處發現了海底泉，且從化學成分和電導率得知，海底泉中混合了大量的富士山地下淡水。
富士山棲息鳥類的鳴聲
可以聆聽「富士山自然環境」中展示的6種鳥類，以及靜岡縣鳥「紫綬帶」的鳴聲。【NPO法人鳥類研究機構提供】
叉尾雨燕
柳鶯
紅腹灰雀
白腹琉璃
黃眉姬鶲
大地鷸
紫綬帶
此處牆面與地面的左官（泥瓦工程）是由左官技能士挾土秀平施作而成，表現出富士山的地層、背景的天空及駿河灣的海底地形。裝修時並未使用顏料，完全以天然土的色調呈現出濃淡層次，富士山背景的天空則是使用紅土。
富士山的一大特徵即為其豐沛水源。從海中蒸發的水於山頂變為雪及雨，並滲入山體的地表下，經過數年後，再自山腹、山麓甚至是海底湧出。此一水循環滋養著從高山帶至駿河灣海底的許多生命。在此，將介紹淺間大社的湧玉池及近年發現的海底湧泉影像，請您在此感受富士山那生機勃勃的水循環。
透過亞克力標本、3D印表機模型和岩石標本，來表現生活在富士山頂到駿河灣海底等，不同海拔高度的動物、植物、昆蟲和魚類，並將標本嵌在牆上，以示富士山的自然環境。牆上的剪影是實物尺寸。
富士山一帶從水深2.500公尺的駿河灣海底到海拔3.776公尺的富士山頂，在嚴酷的自然環境中孕育著各種各樣的生物。
在此為大家介紹每個高度的示例。